FANCL无添加产品不含防腐剂、杀菌剂，所以制造过程必须保持高度洁净。为此，FANCL设立了两座无菌生产工厂——千叶及滋贺工场，配合高科技的无菌生产系统，确保护肤品由原料调制到罐装，都不受污染。

    FANCL无添加护肤品的整个生产过程，都在全封闭的自动化无菌生产线上进行，只配以极少量的工作人员监察设备运作。进入工作间前，工作人员都须通过4道“净化关卡”，换上特制的无尘服装、口罩、帽子和手套，再进行酒精消毒和喷气式去尘处理，以确保不会带入尘埃和细菌。

    在封闭式自动无菌生产系统中，从原料注入生产锅炉到罐装之前，全部都在封闭管道内自动运作，隔绝外界空气。进入“CleanBooth”罐装，是调和后的成品唯一离开无菌管道的瞬间，这里的洁净度更为严格，达到100级。入瓶后，会再次经过高温杀菌处理，确保瓶中的产品处于无菌状态，直到顾客开封。